在二战爆发前的时间里，邓尼茨潜心研究一战经验，进一步从理论上完善了自己独创的“狼群战术”。二战伊始，邓尼茨便率领德国海军以“狼群战术”称霸大西洋，致使盟军商船遭受巨大损失，后勤补给线遭到严重破坏。邓尼茨也因为“狼群战术”的成功而成为希特勒最得力的干将之一。他的职务一路攀升，先后升为舰艇司令、海军司令，最后还被指定为元首的接班人。
然而，邓尼茨同样被眼前的胜利禁锢了头脑，醉心于自己的战术而忽视了再创新，导致德国海军的战术在多年的海战中如出一辙。而盟军则专门组织力量来研究对付“狼群战术”的有效战法，派出规模庞大的反潜飞机和潜艇，灵活采用 “狙击”、“围歼”、“诱杀”等手段来肢解“狼群”，尤其是运用最新型的雷达来搜索德国潜艇。而邓尼茨无视盟军侦察预警能力的提高，依然在大西洋上集结庞大的潜艇群，打算彻底切断盟军在大西洋上的运输线。一九四三年五月，邓尼茨赖以成名的“狼群”终于遭到毁灭性打击———他的王牌潜艇在一个月内被击沉三十多艘。“狼群战术”宣告失败。